1．学生生源的多样性

　　重庆自考学生的生源相对于通过高考进入高校的学生要复杂得多。自考生绝大部分来自于高考失利的高中生、职业高中生、中专生以及少部分在社会工作后又回到学校充电的社会人群，这导致自考生之间文化基础水平参差不齐。部分学生的基础较差，上学也只是家长的意愿，这部分学生学习目的不明确，自我约束力差，环境适应能力差，是非判断能力差，很可能会放任自流，沉迷于网络游戏等不良习惯中去，对学习没信心没毅力。②

　　2．学生管理工作的不规范

　　负责自考生管理工作的专职教师，主要是由高校的老师兼职或是由无编制的招聘人员担任。兼职教师因本身具有相应的工作任务，对学生的管理处于分身无术的状态，这可能会导致对学生心理动态掌握不够及时、管理工作不到位；而招聘教师的人员流动性大，对学生的思想动态的了解没有一个持续性，同时还存在文化道德等素质水平参差不齐的情况。此外，自考学生只需通过专业所要求的课程，即可拿到毕业证书，而学校现行的规章制度主要针对普通大学生，对于自考学生约束力不强。

　　3．师资队伍的不稳定和教学管理的松散

　　一些学校在这个方面往往重视程度不够，部分课程并非由本校老师上课，还存在研究生代替导师上课的现象，教学质量难以保证；而且，在课时安排上，主要考虑了课程考核或任课教师的时间安排，经常出现半天甚至一天内上同一门课，在短期内结束一门课程教学的现象，教学效果难以保证。

　　4．教学与考核的脱节

　　教学与考核的脱节也是一个普遍存在的问题。高校作为助学单位，只是提供课程内容的传授，教学环境的配置，而考核则由国家通过自学考试的形式来进行，这样就容易引起片面追求通过率而忽视素质教育的情况出现。可以这么说，在某种程度上自考生与学校处于矛盾的两个对立面，这也制约了管理工作。

　　5．收费与待遇的不对等

　　由于自考助学这一办学方式是依据市场经济的规则，各项开支都来自于学生缴纳的学费，国家没有任何形式的补贴。与普通大学生相比，自考生所需要交纳的费用更多，但在公共设施的使用上往往受到更多的限制。比如自考生使用机房、语音室的机会明显少于普通大学生；而自考生使用学校的图书馆需要缴纳额外费用；并且在缴纳同样住宿费用的情况下，自考生的住宿条件相对较差。